上海音乐学院音乐研究所成立于1949年，是全国最早的音乐研究机构，由我国音乐学一代宗师沈知白先生亲自创建，粹集我院音乐学科精英，编译国外重要文献，致力著书立说，为我国音乐学的研究打下坚实基础。十年动乱以后，由著名学者钱仁康先生主持工作，在他的领导下，一大批知名专家学者如夏野、谭冰若、罗传开、叶栋、廖乃雄、汪启璋、顾连理、吴佩华以及改革开放后涌现出来和海外学成归来的学者如杨立青、赵晓生、林华、杨燕迪、洛秦、赵维平、孙国忠等，为新兴学科的建设，中外文化的交流、音乐史料的收集、民族音乐遗产的抢救等起了很大的作用，为此，音乐研究所在海内外享有举足轻重的影响和地位。 
　　为了使科研工作更好地服务于社会文明建设、带动学术广深发展和进行音乐教育研究，在院领导的带领下，改变办所机制，实行“科研课题聘用制”，以全院科研发展规划为根据，以开拓新兴学科为抓手，提出一系列探索音乐发展规律和关切社会文化实际的项目，在全国率先制定智力劳务酬金和配置相应科研经费的标准，面向海内外公开招聘科研人员。体制上音研所为科研处实行两套管理体制，一套人员编制，提高了工作效率，精简了人员。这一举措已成为全院体制改革的龙头，带动了全院各部门改革的深入展开。  
　　除课题聘任制以外，音研所也积极地组织和策划院内外以至海内外的学术活动。该所现设有“中日音乐文化交流中心”以及筹建中的“上海音乐学院校史研究中心”和其他相关机构。 
　　我们相信通过科研体制的改革，上海音乐学院音研所将以崭新的面貌对我院以及我国的音乐科研事业作出更大的贡献。